论文查重时参考文献可以不提交，但一般不建议这么做，得看学校具体要求和查重目的。

参考文献本来就是用来标注引用来源的，它不属于论文核心的研究内容，大部分查重系统都有能力识别这部分内容。要是主动把参考文献部分剔除不提交，系统就不会对它进行查重，也就不会影响整体的重复率结果。

参考文献里通常包含大量专业术语、文献名称、作者信息等固定表述，这些内容可能在其他文献里也频繁出现，提交查重的话有一定概率被误判为重复，不提交能避免这种不必要的麻烦。

不过，不提交参考文献也存在一些问题。学校在审核论文时，通常会要求查看完整的论文内容，包括参考文献部分，以此来判断你引用的规范性和研究的严谨性。如果查重时不提交，后续学校查重或者审核时发现参考文献缺失，可能会觉得你论文不完整，影响整体印象。

很多查重系统如知网、jianceku等在检测时，如果参考文献格式正确，能自动识别并排除这部分内容，你正常提交反而能让系统更精准地处理，避免手动剔除可能出现的格式混乱问题。

所以，要是你只是想先自己大概了解论文正文的重复率情况，不提交参考文献也可以。但要是想让查重结果更符合学校最终审核的标准，最好还是按照学校要求来，把参考文献完整提交，让系统自动识别处理，这样既能保证查重结果准确，也能避免后续不必要的麻烦。